对受益人的作用：为其提供了一种有效的风险保障机制。在交易或项目中，受益人往往面临着申请人不履行义务的风险，保函的存在使得受益人在申请人违约时能够通过向担保人索赔来获得经济上的补偿，从而保障其合法权益。
与保证的区别：保证通常是一种人的担保，主要依赖保证人的信用和偿债能力；而保函除了人的担保外，还往往与银行等金融机构的信用和资金实力相关，具有更强的可靠性和独立性。在法律关系上，保证一般是从属于主债权债务关系的从合同，而保函在一定程度上具有独立性，即使基础交易出现问题，只要保函的索赔条件成就，受益人通常仍有权向担保人索赔。
交易情况变化：若基础交易因不可抗力、市场变化等因素导致预付款使用周期改变，双方可协商调整保函期限。如在工程建设中，因自然灾害导致工程延期，预付款使用时间延长，双方可协商延长保函期限。
从法律规定角度看
只要预付款保函期限的约定是在法律法规允许的范围内，且是合同双方真实意思的表示，不存在欺诈、胁迫等违法违规情形，那么保函期限超过预付款使用期限是合法有效的，受到法律的保护。我国《民法典》等相关法律法规尊重当事人的意思自治，允许合同双方根据实际情况协商确定保函期限等条款。